地球科学与工程学院前身可追溯到1922年河海工程专门学校设立的“地学部”。1924年、1927年学校多次合并，直至1952年成立华东水利学院，仍开设地质学、测量学课程。1984年成立勘测系，1995年与土木工程系、工程力学系等合并成立土木工程学院，2009年由原土木工程学院的地球科学与工程系、测绘工程系、水文水资源学院的地理信息科学系，以及科学研究院的同位素水文研究所组建成立地球科学与工程学院。2020年地理信息科学系调归水文水资源学院。

目前学院设有地质科学与工程系、测绘科学与工程系2个教学机构和工程地质与灾害研究所、水文地质与环境研究所、地球关键带研究所、遥感与空间信息研究所、时空基准与卫星大地测量研究所、智能感知与位置服务研究所、地球探测研究所、地下水科学与工程研究所（挂靠）8个科研机构以及地球科学与工程实验中心。拥有南京湖山、浙江天荒坪、江苏句容、安徽桐城抽水蓄能电站等多个教学实习基地，江苏省大型工程地基基础稳定性与安全监控工程技术研究中心、江苏省测绘实验教学示范中心、水利建设“3S”技术应用联合实验室（与香港理工大学共建）等科研平台。

学院现有2个省级重点学科：地质资源与地质工程、测绘科学与技术；2个博士后流动站：地质资源与地质工程、测绘科学与技术；2个一级学科博士点：地质资源与地质工程、测绘科学与技术；2个一级学科硕士点：地质资源与地质工程、测绘科学与技术；2个工程硕士专业学位领域：地质工程、测绘工程。2个本科专业：地质工程、测绘工程，为国家级一流专业建设点、江苏省特色专业、江苏省重点建设专业。地质工程专业、测绘工程专业获教育部工程教育专业认证。

学院现有教职工122名，其中正高32名、副高35名、博士生导师27名，硕士生导师51名，全职外籍教师2名，高级专业技术职务比例占74.4%，博士学位比例为86.31%。教师队伍中国务院政府特殊津贴获得者2人，拥有国家“百千万工程”第二层次培养对象1人，江苏省有突出贡献中青年专家1人，江苏省“333工程”第二层次中青年科技领军人才1人、第三层次培养对象4人、江苏省“六大人才高峰”5人，“青蓝工程”中青年学术带头人3人、骨干教师3人。任地质类教指委副主任委员1人，测绘类教指委委员1人。学院在全国性学术团体中有：主任1人、副会长1人、副主任2人、国内外各类专委会委员8人。学院当年新增江苏省“杰青”1人，国家生态环境保护专业技术青年拔尖人才1人。

学院现有全日制在校学生1472人，其中博士研究生103人，学术型硕士研究生442人，专业学位硕士研究生214 人，本科生682名，留学生31人。学院各专业为中国水利水电、土木、交通等行业培育了大批优秀人才，其中国家高层次人才2名，地质大师2名，在国内外享有很高的声誉。

学院立足于解决水利水电、交通、能源、城建等行业中的重大工程问题开展研究工作，先后参与了长江三峡、黄河小浪底等十多个国家重大水电工程项目的建设，承担了江阴长江大桥、南京长江二桥、三桥和五桥、润扬长江大桥、苏通长江大桥、泰州长江大桥、沪宁高速公路、南京地铁等国家重大交通工程的重要项目，主持了国家重点研发计划项目。近五年来，共承担480项科技项目，项目总经费1.52亿元，发表高水平论文465篇。

学院与美国加州大学伯克利分校、耶鲁大学、新墨西哥大学、加拿大多伦多大学、澳大利亚昆士兰大学、香港科技大学、加拿大地质调查局及国际原子能机构等院校机构建立了广泛国际合作关系。近五年来，举办国际性学术会议5次，留学生共录取44名，其中博士19名、硕士25名，高水平公派研究生33名，出国交流学生197名。